Você deve vincular a ação ao scancode ou keycode do Super ; teclas de atalho normais registram o estado das teclas modificadoras e descartam seus eventos de pressionamento de tecla; para que você nunca veja algo que reaja a apenas pressionar Alt , mas sim à tecla A mais o estado gravado da tecla Alt .
A biblioteca de atalhos em uso é libgtkhotkey (0.2 em 12.04) e não suporta o uso do evento de pressionamento de tecla dos modificadores. Você teria que escrever seu próprio patch para pegar isso e talvez suportar tal coisa no formato de assinatura.
Todos os testes com o formato de assinatura existente não produziram nada além de um erro.