Isso porque você quebrou os pacotes. E as alterações aplicadas por meio da ferramenta tweak permanecerão mesmo se a ferramenta for removida. Além disso, a ferramenta de ajuste de unidade foi removida do sistema durante a atualização ou durante a instalação de outro pacote.
Você pode fazer algumas coisas.
1) Executar
sudo apt-get install -f
veja se isso corrige.
Se isso não acontecer,
2) Você instalou alguma atualização recentemente ou qualquer novo software usando algum ppa? Em seguida, remova o ppa ou qualquer outro ppas indesejado usando
sudo apt-get install ppa-purge
sudo ppa-purge ppa:yourppaname/here
3) Em seguida, execute
sudo apt-get install -f
sudo apt autoremove
sudo apt-get install unity-tweak-tool