Isso depende de qual sistema operacional os usuários finais estão usando, seguido por sua versão do IE. Você pode executar um GPO para forçar o usuário a usar um proxy, você pode querer leia isto.
O ideal é que você também tenha apenas um script de login que faça algo semelhante a:
Regedit4
[HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Internet Settings] "MigrateProxy"=dword:00000001 "ProxyEnable"=dword:00000001 "ProxyHttp1.1"=dword:00000000 "ProxyServer"="http://ProxyServername:80" "ProxyOverride"=""
Você pode ler este aqui .