Seu comando deve ser
find . -name '*.php' -exec sed -i 's/);"/, \'width=100%');/' {} \;
Não há necessidade de um pipe com xargs : a opção -exec fará exatamente isso para você; também -print não é necessário.
Os separadores '...' protegem o texto a ser alterado do shell; por este motivo você precisa escapar ( ie , para preceder ' com uma barra invertida, \' ) o apóstrofo dentro de sua substituição para dizer sed : veja, este não é o fim do s padrão, mas um caractere literal que deve ser considerado parte do padrão.