Ok, resolvi e veja como:
Então, basicamente eu consegui obter um erro Syslinux ao tentar arrancar em vez de apenas um "sistema operacional ausente" quando eu usei o criador do disco de inicialização. Isso obviamente me levou a acreditar que era um problema com o syslinux. Eu também sabia que o Ubuntu MATE seria inicializado. Então, o que eu fiz foi ter duas partições em um disco rígido externo (você pode fazer isso com uma única unidade flash também) e, usando o Criador de disco de inicialização, instalou o Kubuntu em um e o MATE no outro. Então entrei na pasta syslinux na partição do Kubuntu e copiei todos os arquivos .cfg e imagens (.pcx, .jpg, .png) e coloquei em uma pasta em outro disco rígido. Uma vez que estas foram seguras, eu apaguei as pastas syslinux e boot . Então, eu fui para a partição MATE e copiei essas duas pastas da partição MATE para a partição do Kubuntu. Por fim, eu copiei os arquivos e figuras .cfg e substituí os arquivos na pasta syslinux que acabei de colar na partição do Kubuntu. Eu tenho o gfxboot-com32-whatever (solução para isso aqui ) e, em seguida, arrancou até!