Poderia ser que você esteja usando os ambientes de desktop XFCE (Xubuntu) ou LXDE (Lubuntu)?
Seus compositores têm problemas comuns com as placas de vídeo Nvidia mais recentes. Se esse for o caso, tente desabilitar o compositor nativo e instale "Compton" ou "Compiz". Isso deve resolver o rasgo.
Se esta não for a solução, tente configurar a opção "PowerMizer" para Maximum Performance nas configurações da Nvidia e veja se isso muda alguma coisa, também certifique-se de que o VSync esteja habilitado lá.