Você pode usar o gdb para depurar seu código c. O Gdb está disponível sob o fedora, como é em praticamente todas as distribuições Linux.
Tenha em mente que o gdb é uma ferramenta de linha de comando. Se você quiser usar um IDE, você tem que escolher entre uma vasta abundância de ferramentas. Por exemplo. Eclipse, kdevelop, anjuta, netbeans IDE, emacs apenas para citar alguns dos quais estão disponíveis para o fedora ou, pelo menos, são fáceis de instalar.