Não haverá problema. Eu suponho que você é dual boot Windows e Ubuntu. Se for esse o caso, basta atualizar o Windows 8.1 com o Windows Update para o Windows 10.
Meu laptop está rodando no Windows 8.1 e um ano antes de instalar o Ubuntu Linux. Se eu tentar atualizar para o Windows 10, haverá um problema ou não, por causa do Liniux?