Eu não tentei, mas Synergy parece fazer o que você precisa.
Procurei on-line e há uma solução chamada ShareMouse , que é o equivalente em Mac de Mouse without borders da Microsoft. Até onde eu sei, não há uma maneira compatível com Linux para fazer isso.
Alguém conseguiu usar o teclado e o trackpad do MacBook para controlar um desktop Linux? Se sim, como?