Se as substrings forem todas do mesmo tamanho, você pode usar um renomeador de arquivo simples para se livrar delas por truncamento (por exemplo, Renomear Lupas ou um dos muitos que você pode obter do nonags.com).
Você pode ter que adicionar um sufixo numérico aos arquivos, no entanto, se muitos tiverem o mesmo nome de arquivo principal (a maioria dos renomizadores pode fazer isso na mesma operação).
Eep! Eu não percebi a tag do Mac. Esqueça o que eu disse sobre o Lupas Rename e nonags.com - você precisará de um equivalente para Mac.