Além dos comentários de Techie007 sobre a alteração do resolutino no cliente RDP antes da conexão, observei que ao conectar ao Server 2012R2, se você tivesse uma conexão de console estabelecida anteriormente, a conexão rdp poderia usá-la em vez de iniciar uma nova sessão. Nesse caso, a resolução será desativada.
Eu percebi isso ao usar o Gerenciador de conexões de área de trabalho remota v2.7 quando a resolução estava definida como "Igual à área do cliente".
A chave para resolver isso foi fazer logoff da sessão em vez de desconectar e, em seguida, fazer logon novamente.