Demorei quase um ano para descobrir isso, mas localizei o problema no HWMonitor . Eu estava executando a versão 1.1.7.0, que aparentemente não era compatível com o Skylake, nem com o Windows 10. Eu não tinha idéia de que os aplicativos de espaço do usuário poderiam derrubar um sistema operacional dessa maneira, mas aparentemente eles podem. A atualização para a versão mais recente do HWMonitor corrigiu o problema. Por favor, note que CPU-Z é afetado pelo mesmo bug (a versão mais recente também corrige isso).
Referências:
Aprendi outra lição durante a depuração desse problema: O registro em diário do NTFS protege apenas os metadados do sistema de arquivos. Isso não impedirá que seus dados sejam corrompidos! link
Quando testar seu sistema sempre, SEMPRE desative o cache de gravação do disco rígido. Se não o fizer, as falhas do sistema resultarão no zeramento do conteúdo do arquivo, apesar de o Windows informar que o disco está limpo.
UPDATE : Depois de corrigir o problema HWMonitor mencionado acima, parei a experiência que a interface do usuário trava (onde um processo travaria enquanto outros seriam executados). No entanto, continuei experimentando travamentos em todo o sistema em que o mouse / teclado não respondia. Esses traps ocorreriam aleatoriamente, às vezes quando o sistema estava ativo, outras vezes quando ocioso.
Demorei mais alguns meses para rastrear isso. Acontece que eu tinha dobrado pinos de soquete da CPU na placa-mãe. Eu não tenho experimentado um único travamento ou falha desde a substituição da placa-mãe.