Por COMMAND=$(php travis_groups.php) você acabou de atribuir o comando à variável COMMAND . Se você quiser executar o comando, precisará adicionar $COMMAND após a atribuição.
Exemplo simples de configuração:
echo.sh arquivo contendo apenas linha echo "ls"
run_echoed.sh arquivo contendo duas linhas:
COMMAND=$(bash echo.sh)
$COMMAND
Quando você executar run_echoed.sh (seja por ./run_echoed.sh se o arquivo for executável ou bash run_echoed.sh ), você imprimirá o conteúdo do diretório (o comando ls será executado).
Claro, certifique-se de que seu php travis_groups.php imprima os comandos (apenas execute no terminal). Caso contrário, você não pode dizer ao outro script o que atribuir à variável.