Na linha de comando, cd para o seu diretório de instalação OwnCloud. Você encontrará um script chamado occ there. Este é o cliente de linha de comando do OwnCloud.
Verifique primeiro suas configurações de LDAP (talvez seja necessário executá-lo como o usuário que possui os diretórios OwnCloud):
php5 occ ldap:show-config
Isso imprime uma tabela, o cabeçalho geralmente diz | Configuration | s01 | (referindo-se ao primeiro servidor LDAP), mas em vez de s01 você pode ter uma string vazia ou s02 . Vamos supor que seja s01 . Verifique o que a configuração useMemberOfToDetectMembership diz. Para defini-lo como 0:
php5 occ ldap:set-config "s01" useMemberOfToDetectMembership 0
Lembre-se de usar o que for apropriado em vez de "s01" acima.
PS. Eu usei isso com OwnCloud 8.2, mas é muito provável que funcione com outras versões também.