Você pode usar a SUBTOTAL
-função . Dependendo de se você deseja incluir linhas manualmente ocultas ou não, você usará:
=SUBTOTAL(9,A1:A1000)
ou
=SUBTOTAL(109,A1:A1000)
O último não incluirá linhas manualmente ocultas, o primeiro será. Ambos irão ignorar linhas filtradas.