Você pode adicionar a opção de comando --window-position
: link :
google-chrome --window-position=0,200
A janela não deve ser maximizada (não encontrei uma flag para fazer isso).
Como fazer isso depende do sistema operacional: link
Não é uma solução perfeita e uma maneira mais simples de obter o mesmo resultado é posicionar a janela do Chrome por conta própria. A posição deve ser armazenada quando você a fechar.