Você pode adicionar o caminho dos aplicativos instalados a .bashrc (presumindo que você esteja usando BASH ).
Simplesmente abra o .bashrc com seu editor favorito e insira uma nova linha com PATH=$PATH:/mountpoint/bin
onde mountpoint é o ponto de montagem de seu armazenamento externo.
bin é o diretório de seus aplicativos usados. Você pode até adicionar mais se quiser, como por exemplo PATH=$PATH:/mountpoint/bin:/mountpoint/sbin:/mountpoint/usr/bin:/mountpoint/usr/sbin .