Você pode usar a ajuda embutida digitando C-h a e a palavra whitespace
. Irá listar por exemplo
delete-trailing-whitespace M-x ... RET
Delete trailing whitespace between START and END.
fixup-whitespace M-x ... RET
Fixup white space between objects around point.
A primeira elimina espaços em branco à direita dentro da região atual. O segundo faz o que você quer, no ponto. Clique no botão 2 no nome da função para obter mais informações.
Nem provavelmente tem uma ligação padrão para você, então para executar o segundo você digita M-x e os primeiros chars fixup-
e tab para completar.
Adicione sua própria ligação a uma chave para facilitar o uso.