Eu acredito que existem opções de estilo LVM para você montar um dos servidores NAS no outro e tê-lo Espelhar o sistema de arquivos. O maior problema com essa abordagem é que ela será muito mais lenta. e você ainda precisa fazer uma pequena interrupção quando mudar para o destino final.
Minha recomendação seria fazer uma execução do Rsync com tudo on-line e fazer uma segunda execução copiando as atualizações somente após parar todas as gravações. Isso lhe dá tempo para atualizar todas as configurações que apontam para o antigo NAS.