Parece que esta mensagem é exibida quando o jitsi já está em execução, o que você pode testar com algo como ps -ef | grep jitsi . Há também um arquivo de bloqueio: ~/.jitsi/.lock .
Eu tive esse problema ao tentar executar o jitsi com o java 8. Aparentemente, o jitsi não roda com o java 8: [jitsi-dev] O Jitsi não funciona no Java 8
Usar o java 7 corrige isso.