Infelizmente, isso não é possível no Outlook. Suas regras só podem ser executadas automaticamente para mensagens Inbox . Você só pode executar regras para pastas selecionadas no modo manual (usando o botão Executar regras agora ... acima da lista de regras).
A solução possível é executar as regras necessárias em relação às pastas necessárias usando a macro VBA por timer.