No Impress, o LibreOffice v. 4.4.3.2, salvar o espaçamento entre linhas em um arquivo formatado em PPT funcionou quando usei o ícone da ferramenta Espaçamento entre linhas : Talvez o método que você está usando para adicionar espaçamento de linha não seja compatível com o formato PPT, em vez do formato ODP nativo, mas o formato da ferramenta Espaçamento de Linha é mantido.
Além disso, você não mencionou a versão do LibreOffice; o comportamento pode ser diferente em outras versões ou outro SO (meu teste foi feito em um PC com Windows).