Você pode armazenar em cache algum tipo de comando "post-start" no seu x-server antes de ser inicializado. No entanto, Run Level 5 pode ser o começo da sua interface gráfica no seu sistema operacional. Para risos, tente algo como:
#!/bin/sh
# the extra bash command is to keep the window open
xterm -e 'echo "Hello Run Level 5"; bash'