Eu não acho que 50 GB é um monte de dados para manter sincronizado, mas se você realmente quiser complicar sua configuração, você pode olhar para rdiff-backup . Você pode enviar incrementais para um servidor e depois restaurar para sua outra máquina. Isso pressupõe que sua segunda máquina é uma cópia exata do seu primeiro computador sem as alterações incrementais. Eu acho que o que você quer pode realmente ter resultados desastrosos e pensar que é melhor sugá-lo e usar um software de sincronização como o Bittorrent Sync sobre hospedagem incrementais em um servidor que você irá recuperar.