Eu também tenho uma instância ec2. E eu também encontrei o Agendador de Tarefas para não funcionar.
Em vez disso, faça o seguinte, supondo que você use a ferramenta de área de trabalho remota do Windows para usar a instância :
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Conecte-se à sua instância ec2
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Tela cheia na janela da área de trabalho remota
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Pressione WIN + R
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Digite shell: startup e pressione Enter. Uma pasta deve abrir.
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Crie um atalho para cada um dos seus arquivos que você deseja executar na inicialização e coloque os atalhos na pasta que você acabou de abrir
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Reinicie o servidor para ver se funciona corretamente.
SE VOCÊ NÃO USAR O DESKTOP REMOTO DA WINDOW PARA USAR A INSTÂNCIA DO EC2, NÃO SEI COMO AJUDÁ-LO