Se o Ubuntu ainda estiver funcionando, você pode transferir uma imagem inicializável para o seu USB com algo parecido com isto:
dd if=CentOS-6.6-x86_64-bin-DVD1.iso of=/dev/sdb
Substitua / dev / sdb pelo dispositivo da sua unidade USB.
Em seguida, reinicie com o seu USB e passe pelo instalador. Quando terminar de instalar, você pode instalar pacotes adicionais do DVD2 a partir do CentOS.
Veja InstallFromUSBkey para mais.
Você não precisa mesclar os dois DVDs para alcançar sua meta de instalar o CentOS.
Boa sorte!