Existe um utilitário freeware que fará isso, o NirCmd. Você pode baixá-lo aqui .
Para definir o volume do sistema, basta digitar:
nircmd.exe setsysvolume 65535
Como o volume varia de 0 a 65535, para um volume de cerca de 30% (de 100), você digitará:
nircmd.exe setsysvolume 19661