Consegui habilitar o segundo cartão MIC no mesmo servidor com vários comandos do link . As chaves são duas etapas em "2.2 etapas para instalar o Intel (R) MPSS":
micctrl --initdefaults
e "2.4 Atualizações do Flash e SMC do coprocessador Intel Xeon Phi (TM)"
/usr/bin/micflash -update -device all -smcbootloader
Eu não precisei instalar um módulo MPSS separado para o cartão mic1 como eu considerei antes.