Eu não sei sobre o Ubuntu, mas eu sei que algumas outras distros suportam o uso de despejos de disco para fazer backup de seus dados / sistema. Veja mais aqui: link
Acredito que, para seus propósitos, você estaria clonando o disco inteiramente para o seu disco rígido de backup
Deixe-me saber se funciona:)
EDIT: Acabei de encontrar a documentação relevante do Ubuntu, aqui está um link .