Você precisa usar a diretiva SetEnvIf e adicionar qualquer Request_URI correspondente a um log personalizado. Por exemplo:
SetEnvIf Request_URI /request/to/match$ mycustomlogfile
CustomLog mycustomlogfile.log common env=mycustomlogfile
Para mais detalhes sobre como usar SetEnvIf , confira como paginar no HowToForge.com Como dizer ao Apache para não registrar certos Solicitações em seu log de acesso (Nota: Embora o tutorial seja sobre não registrar certas solicitações no apache, ainda é uma boa informação sobre o uso da diretiva SetEnvIf .)