Diferentes jogos se comportam de maneira diferente no modo de tela inteira. Se você pode rodar o jogo em uma janela ou em uma tela inteira, você não deve ter esse problema. Se você precisar executar em tela inteira, não faça a ALT-TAB se souber que há um problema. A maneira como o subsistema de gráficos se comporta com os jogos de tela inteira (sem janelas) é completamente diferente de um aplicativo de janela.
Você está dizendo que ele usa para funcionar corretamente antes da sua reinstalação e agora não funciona (você não está claro sobre isso).