Você pode usar os recursos do Compiz para conseguir isso. Primeiro instale o pacote compizconfig-settings-manager . Em seguida, inicie o gerenciador, localize o plug-in "Place Windows" (seu ícone é uma seta azul apontando para baixo) e selecione a segunda guia, que descreve as regras de posicionamento da janela. Você pode definir as janelas desejadas e suas posições lá, no primeiro campo. Para informações adicionais, dê uma olhada aqui: link e aqui: link . Você pode obter o título exato da janela com xwininfo (apenas marque a janela desejada com a cruz e leia o título após o ID da janela numérico). Em seguida, crie uma nova entrada, defina a regra de seleção como title=Window_name_from_the_previous_step , defina as posições X e Y desejadas no canto superior esquerdo, ative a caixa de seleção Constrain workarea . Deve funcionar.