Ok, eu mesmo encontrei a resposta, que postarei para qualquer pessoa com o mesmo problema. Acontece que, após a reinicialização, o sistema não reconheceu as posições físicas dos monitores. Para corrigir, que foi por acidente testar as coisas, fiz o seguinte:
Clique com o botão direito em uma área em branco na área de trabalho e selecione Resolução da tela. Uma foto dos dois displays aparece.
Clique em Identificar. Numerais grandes aparecem nos monitores e foi quando percebi que eles foram trocados de volta para a frente - o monitor que está realmente à direita apareceu à esquerda neste layout.
Arraste a imagem do monitor que está no local errado para o local correto e clique em Aplicar.
Problema resolvido.