Encontrei duas soluções prováveis para você. Uma é alterar o shell padrão para o usuário que estará remotamente para o seu computador o programa que você quer que ele seja capaz de executar. O segundo não parece seguro, mas parece que é mais limpo, você modifica um arquivo de conexão rdp para ser um arquivo remoteApp .. então sim.
"Sim, você pode alterar o shell padrão do Explorer.exe para um aplicativo específico.
No Regedit, navegue até NT \ CurrentVersion \ Winlogon do HKEY_LOCAL_MACHINE \ SOFTWARE \ Microsoft \ Windows. O shell atual deve ser o Explorer.exe. Altere para YourApp.exe. Isso mudará o shell para todos os usuários que fizerem logon na máquina. Se você quiser alterá-lo apenas para um usuário específico, vá para a mesma chave em HKEY_CURRENT_USER. "- Chrissr