Dada a captura de tela, recomendo que você prepare manualmente o novo disco e, em seguida, copie apenas as partições System Reserved e Storage (que suponho que o sistema está instalado) para o novo disco usando algum utilitário que funcione no Windows. Tente Macrium ou EaseUS ou algo parecido.
De qualquer forma, use o DISKPART no prompt de comando para criar uma partição primária de 100MB com offset de 1024KB, que é o seu Sistema reservado. Em seguida, crie sua partição do sistema e clone sua instalação do Windows nela. Basicamente, você está tentando imitar a instalação padrão. Seu utilitário de clonagem deve tomar cuidado com o sinalizador de inicialização, mas se não, você pode definir manualmente .
Aqui é como usar o DISKPART.
OK, se tudo estiver bem até agora, você deve ter um sistema não inicializável agora.
Agora lembre-se desse deslocamento? É aí que o seu bootloader vai. Eu sugiro ligar apenas o seu novo disco e reparar o bootloader usando o disco de instalação do Windows.
Aqui é como você faz isso.
Esteja avisado que este é um trabalho muito tedioso, portanto você pode considerar uma nova instalação do Windows, pode ser menos trabalhoso se você não tiver muitos programas ou personalizações instaladas ...