Esta parece ser uma questão amplamente divulgada. Supondo que você não veja a opção de definir seu modo de cor com profundidade de bits adicional, como sugere, você pode tentar algumas sugestões na web, já que muitos usuários relataram diferentes 'correções' para cada indivíduo.
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Tente modificar seu xorg.conf: link (parece corrigir a maioria das reclamações - procure a adição 'vboxvideo')
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Atualizando todo o nosso software para os pacotes mais recentes: link (A maioria diria que você já tentou isso, mas vale a pena mencionar) Eles também discutem a adição do driver 'vboxvideo' aqui.
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Desativando a mensagem: link (assumindo que nada conserta, e você está focado na automação)