Se funcionou antes, talvez você tenha atualizado recentemente seu kernel, mas não tenha feito uma reinicialização - isso explicaria porque modprobe tun falha. Verifique sua versão do kernel em execução:
uname -a
e sua última versão do kernel instalada (você pode usar pacman -Q linux no Arch ou procurar em /lib/modules/ na maioria dos sistemas). Se eles não coincidirem, reinicie - o kernel mais recente será carregado e tun module com ele.