Lendo as especificações do seu link, presumo que sua placa-mãe possa levar a DDR2 DRAM PC3200 como a velocidade máxima de seus cartões de memória. PC3200 é memória a 400Mhz.
Se você colocar uma memória de clock maior, ela funcionará a 400Mhz. A única diferença pode estar na latência , mas para pessoas normais que não trabalham ou jogam somente benchmarks durante todo o dia, não há diferença visível.
Então a resposta é não, você não verá nenhum impacto significativo.