Seu projeto só é "alterado" para VS2012 quando você o abre pela primeira vez no VS2012 (e ele será avisado antes de executar a conversão). Se você abrir o projeto antigo no VS2008, ele funcionará bem.
Possivelmente, o que você está vendo é que a associação de arquivos para seus arquivos de solução foi alterada, para que eles sejam abertos por padrão no VS2012. A maneira de contornar isso é abrir o VS2008 manualmente e usar o "Open Solution" para carregar seu projeto antigo, em vez de abrir o projeto a partir de um atalho direto.