Você poderia tentar sem montar sua unidade NTFS anteriormente, apenas iniciando o Dropbox mais tarde.
#!/bin/bash
#insert seconds to wait before dropbox start
wait 15
dropbox
Adicione esse script aos seus aplicativos de inicialização.
Allthough eu não tenho certeza porque você tem esse problema, eu nunca tive esse problema e eu sempre tive o diretório do Dropbox em uma unidade NTFS.