Eu tinha uma placa-mãe da ASUS que não inicializava a partir do USB, a menos que você passasse pelo menu de inicialização único. Não importava se você dissesse ao BIOS que era um USB FDD, um USB HDD ou uma terceira opção "USB"; simplesmente nunca funcionou.
Em vez disso, quando você inicializar, tente pressionar F12 repetidamente. Com alguns BIOS, isso abrirá um menu para selecionar o dispositivo para inicializar. Espero que a unidade USB esteja listada lá. Funcionou para mim:)
Boa sorte.