Tente usar o SETX,
Defina as variáveis de ambiente, SETX pode ser usado para definir as variáveis de ambiente da máquina (HKLM ) ou usuário atualmente conectado (HKCU):
Defina a variável _my_count como '5' no ambiente dos usuários:
SetX _my_count 5
leia a variável de ambiente mais tarde ...
IF "%_my_count%" == "" GOTO DOTHIS
outra forma seria usar o registro e o comando REG.