no computador em que estou, só tenho um sistema operacional e não consigo elaborar muito sobre isso, mas
tente a aba de inicialização do msconfig. por exemplo, start..run..msconfig, clique na guia "boot". que deve mostrar-lhe os sistemas operacionais mostrados no menu de inicialização e pode haver uma opção para excluir um indesejado
alternativamente
tente abrir um prompt do cmd como administrador e executando o bcdedit (se você não abrir o prompt do cmd como administrador ele agirá como se o bcdedit não existisse) e há uma opção delete com esse comando.
O Windows XP costumava ter boot.ini que poderia ser editado. O Windows 7 não.
E se você fosse de alguma forma atrapalhar, sempre pode ser reconstruído. link