No Thunderbird, use Ferramentas > Configurações da conta. Ir para Cópias & pastas para a conta em questão. Observe Quando Enviar Mensagens Automaticamente "e certifique-se de que a opção" Colocar uma cópia "esteja selecionada, em seguida," Pasta Enviada em ... "ou se em Outro, verifique se está em" Caixa de saída "e não na pasta Arquivo.
Abaixo disso, desmarque a opção "Manter os arquivos de mensagens em" completamente.