Eu acho que você terá que renomear suas tarefas para incluir "Toggl" nelas de alguma forma (e editá-las se você as estiver enviando para clientes) ou atribuí-las a um projeto chamado "Toggl". Nenhum destes parece muito prático embora.
Caso contrário, você precisa reclamar com os designers do Toggl e dizer que em vez de alterar o título da janela / guia para o nome da tarefa, eles devem ser mais consistentes e usar "Toggl" para tudo ou "Toggl - (taskName)" como o formato de suas guias.
Eu vi isso também sendo corrigido por um script Greasemonkey ou por um script do usuário em execução no Chrome que mantém o título da janela permanentemente em "Toggl" para esse site, mas não sei o suficiente sobre os scripts de usuário para criar um.
Se você estiver disposto a dar uma chance aos userscripts, este parece ser um bom começo.