Para responder à sua pergunta, o problema não tem nada a ver com o disco rígido externo. Você mesmo disse, o disco rígido do seu laptop está morrendo, então talvez os arquivos que você está tentando copiar estejam localizados em setores defeituosos do disco rígido, o que pode ser a razão para o aumento substancial no tamanho dos arquivos.
Excluir o software que já estava no novo disco rígido não tem nada a ver com isso. Seu disco rígido externo provavelmente foi pré-formatado usando o sistema de arquivos NTFS. O particionamento do HDD não terá absolutamente nenhum efeito se os arquivos que você está tentando copiar do HDD do seu notebook estiverem corrompidos.
O que você pode fazer é tentar recuperar dados do disco rígido do seu laptop usando um software de recuperação de arquivos, como o Recuva , TestDisk ou Phoenix estelar .
Você também pode querer verificar a S.M.A.R.T. informação do disco rígido do seu laptop para ver quão ruim é a situação. Use CrystalDiskInfo para essa finalidade.
Terá de ligar o disco rígido do seu portátil a um computador com o CrystalDiskInfo para ler o S.M.A.R.T. em formação. Você poderia usar um gabinete USB 2 HDD barato de 2,5 polegadas como este .
Como alternativa, você pode usar um disco de inicialização como BootMed para ler o SMART dados