Depois que descobri que estava conectado como um perfil temporário, encontrei este post útil que inclui diversas correções para problemas com contas temporárias. link
Uma coisa é que eu deveria ter executado o sfc em vez do chkdsk. Talvez isso tenha evitado muitos problemas.
Por fim, corrijo o problema editando o registro. HKEY_LOCAL_MACHINE \ SOFTWARE \ Microsoft \ Windows \ CurrentVersion \ ProfileList incluiu duas entradas para o meu login do Windows. Um com .bak que era meu antigo C: \ Users \ Dan e o atual apontava para C: \ Users \ Temp. Renomei o atual e removi o .bak do antigo, reiniciei e minha conta agora foi vinculada novamente.