Este não é um problema global de "Ubuntu", depende de qual gerenciador de janelas / ambiente de desktop você está usando, talvez até problemas de versão.
Estou no 12.04 Ubuntu usando o Gala / mutter e o meu (atual estável) O Chrome não mostra este problema.
Note que o atalho de teclas para o 'menu de janelas' é definido no org.gnome.desktop.wm.keybindings do Dconf, mas muitos wm / de 's possuem outros locais onde suas ligações (às vezes diferentes sobrepostas) podem ser customizadas.