Qual versão você está executando? Parece que você talvez tenha aberto um segundo aplicativo, que pode ser o seu problema. Se você abrir sua pasta de trabalho original primeiro e, em seguida, abrir o aplicativo do Excel novamente e usar essa segunda janela para abrir a outra pasta de trabalho, esse problema será seu.
Além disso, verifique em Arquivo > Opções > Avançado > Geral e verifique se a caixa intitulada "Ignorar outros aplicativos que usam DDE" NÃO está marcada. Nesse caso, o Excel sempre abrirá uma nova instância ao abrir um arquivo. (Estou executando o Office 2010.)