Esta é uma excelente pergunta. Eu tive isso acontecer. Não foi divertido.
Em termos práticos, o CD do SuperGrub ( link ) provavelmente poderá ajudá-lo a se recuperar quando isso acontecer.
Eu tentei coisas como instalar o GRUB em ambos os discos, certificando-se de que as unidades fossem as mais idênticas possíveis ... Mas SuperGrub é a abordagem que funcionou.
Se você fizer isso e estiver falando sério, você deve testar para ver se consegue inicializar o sistema com o disco e sincronizar novamente o espelho quando ele estiver em backup. A ressincronização também é mais difícil do que deveria / parece, portanto, certifique-se de documentar essa parte.